Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ccdc113Q8C5T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc113Q8C5T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms