Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp37Q8C0R0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp37Q8C0R0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp37Q8C0R0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp37Q8C0R0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp37Q8C0R0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp37Q8C0R0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp37Q8C0R0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Usp37Q8C0R0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Usp37Q8C0R0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Usp37Q8C0R0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp37Q8C0R0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Usp37Q8C0R0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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