Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp47Q8BY87 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp47Q8BY87 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms