Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn17Q8BXA6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms