Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp5Q8BX09 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms