Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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