Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4aQ8BW72 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms