Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scfd2Q8BTY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scfd2Q8BTY8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms