Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap4Q8BMK4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms