Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp54Q8BL06 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp54Q8BL06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms