Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zcchc4Q8BKW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zcchc4Q8BKW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms