Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan12Q8BKT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms