Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Susd4Q8BH32 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd4Q8BH32 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd4Q8BH32 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms