Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmco3Q8BH01 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmco3Q8BH01 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms