Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms