Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Htatsf1Q8BGC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms