Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sptlc3Q8BG54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptlc3Q8BG54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptlc3Q8BG54 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms