Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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H2-M10.4Q85ZW8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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H2-M10.4Q85ZW8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.4Q85ZW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms