Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4cQ811C2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4cQ811C2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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