Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms