Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8Q80YR6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms