Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b1Q80VQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b1Q80VQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms