Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3cQ80U95 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms