Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lca5Q80ST9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lca5Q80ST9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms