Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mcph1Q7TT79 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcph1Q7TT79 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms