Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccp110Q7TSH4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms