Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms