Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms