Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actn1Q7TPR4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actn1Q7TPR4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms