Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ShprhQ7TPQ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ShprhQ7TPQ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.7 ms