Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prrc2bQ7TPM1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prrc2bQ7TPM1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms