Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eci3Q78JN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms