Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1cQ76I25 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms