Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms