Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nemp1Q6ZQE4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nemp1Q6ZQE4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms