Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp34Q6ZQ93 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms