Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy1Q6ZQ11 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms