Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms