Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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