Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms