Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rhox8Q6VSS7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms