Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc88cQ6VGS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms