Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timd4Q6U7R4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timd4Q6U7R4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms