Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja6Q6S5G4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms