Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms