Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HjurpQ6PG16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HjurpQ6PG16 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HjurpQ6PG16 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms