Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms