Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gramd2bQ6PEM6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gramd2bQ6PEM6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms