Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms