Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms